大学校区和分校是不一样的，主要有以下三个方面的差别：
     一是名称上的区别，校区全称是××大学××校区，而分校则是××大学××分校。如东北大学秦皇岛分校，哈尔滨工业大学(威海)、山东大学(威海)等，校区一般用括弧表示。
     二是管理上的区别，校区是直属本校，由本校直接管理、负责；分校属于挂着本校的牌子，独立运作，和本校的关系属于合作关系。
     三是配套上的区别，校区因为直属本校，所以在资源配套上是和本校共享的，教育质量和本校是一样有保障的；而分校因为独立运作，所以在资源配套方面落后本校，相对教育质量较低。所以分校一般比大学要差点，毕业证也有区别，而校区和大学（即本部）的毕业证则完全一样。
     例如西南交通大学招生章程规定：在峨眉校区就读的第二批次本科生，以西南交通大学和西南交通大学校长具印颁发本科毕(结)业证书，证书内容填写“在我校峨眉校区××专业学习”。